网站建设合同协议书包括技术开发、知识产权、数据安全和费用结算等内容，归口管理要根据合同的主要内容和组织内部的职责分工来确定。
如果合同以软件定制开发为主的话，那么技术部门就负责需求确认、功能验收以及后期的运维工作，归口管理权一般属于技术部或者信息科技部。如果合同侧重于页面设计、内容更新和品牌展示的话，市场部或者品牌部就会负责把控视觉风格和传播效果，归口管理权由他们来行使。涉及金额较大或者长期服务框架协议的情况下，法务部门要审核条款的合法性，财务部门要监督付款节点，这种情况下多部门协同联签是常态。
有的单位设立了采购部或者合同管理部来统一归档编号，但是业务的主导权仍然由需求发起部门掌握。确定归口管理部门的关键是识别出合同的主要履约内容，防止权责交叉造成验收拖延或者纠纷处理推诿。建立标准化的审批流程，把技术、法务、财务的意见融入到各个节点中，可以提高合同执行效率。
总结：
网站建设合同的归口管理没有固定的模式，按照合同标的的属性来匹配核心业务部门的原则，再加上跨部门协作机制，保证从合同签订到交付的全过程都可以得到控制。